胃肠道传染病指病原体由消化道侵人而引起的传染病。胃，肠道传染病所致的腹泻可由多种微生物引起，如细菌、病毒和寄生虫等。
细菌性痢疾是儿童和成人急性腹泻的常见原因。临床症状为剧烈腹痛、腹泻、大便脓血。个人卫生不良，销售的食物被灰尘、苍蝇等污染,或食品加工条件不卫生，直接或间接经粪、口途径传播。霍乱是甲类传染病，当前多以霍乱弧菌Eltor弧菌引起，腹泻是其突出的症状，可发生爆发流行；三分之一的伤寒病人可发生腹泻。
大肠杆菌所致肠炎通过污染食物和水，可以在公共团体和幼儿保育单位发生爆发流行;沙门菌所致肠炎通过摄人被人或动物粪便污染的食物而感染本病;空肠弯曲菌的病人大便恶臭，肉眼可见出血或隐血,并有脓细胞。
病毒也可以引起腹泻(如轮状病毒、柯萨奇和埃克病毒引起的胃肠炎，包括婴幼儿腹泻)。
溶组织阿米巴可引起腹部不适、腹泻、病原虫、大便带血及黏稠便。肠兰贾第鞭毛虫可引起慢性腹泻，次数频繁,大便呈灰色油腻状。
发现胃肠道传染病的腹泻症状后要及时就诊。